350,"La muerte de Minato"

Después de que Kakashi se une a los ANBU, Minato le pide a el y al resto del escuadrón estar atento a posibles ataques con el fin de quebrantar la paz que se acaba de lograr, poco después guardias de Konoha son atacados por ninjas de Iwagakure que finalmente son acabados por Kakashi. Por otra parte Kushina se entera de que esta embarazada y se lo revela a Minato el cual le pide a Kakashi ser el guardaespaldas en secreto de esta hasta el momento del parto, así pasados los meses el nacimiento de Naruto esta cerca donde Tobi interfiere e invoca al Kyūbi destruyendo Konoha, Kakashi y los otros son llevados donde no interferirán. Después de que Minato y Kushina logran sellar al Bijū, Hiruzen llega promete hacerse cargo de Naruto. Días después el funeral de Minato y los demás shinobis caídos se lleva a cabo, una nueva reunion se lleva a cabo para elegir al siguiente Hokage pero Hiruzen decide hacerse cargo y dar tiempo a los futuros ninjas. Después de ello Danzō le pide a Kakashi ser su seguidor.